托勒密十三世·西奥斯·菲洛帕托尔 (ptoley xIII theos philopator)，大约公元前62年出生，公元前47年1月13日去世。

他是公元前51年至公元前47年间的埃及法老，是托勒密王朝（公元前305年至公元前30年）最后的成员之一。

他是托勒密十二世·奥莱特 (ptoley xII Auletes) 的儿子，与克利奥帕特拉七世 (cleopatra VII) 同为共同统治者。

克利奥帕特拉离开埃及时，引发了法老之间的内战。

托勒密十三世之后与他的另一位妹妹，阿尔西诺四世 (Arsoe IV) 共同统治。

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托勒密十三世·西奥斯·菲洛帕托尔是埃及法老托勒密十二世·奥莱特 (ptoley xII Auletes) 的儿子，他于公元前51年春继承父亲的王位，成为托勒密王国的法老，年仅11岁。

托勒密十二世在遗嘱中规定，托勒密十三世将与他的姐姐克利奥帕特拉七世 (cleopatra VII) 结婚，并共同执政。

公元前50年10月，托勒密十三世与克利奥帕特拉七世一同被提升为高级统治者，尽管宦官波西努斯 (poth) 充当了托勒密十三世的摄政。

公元前48年春，托勒密十三世和波西努斯试图废除克利奥帕特拉七世，因为她作为女王的地位日益上升。

这时期，克利奥帕特拉的面容出现在了铸造的硬币上，而托勒密十三世的名字则在官方文件中被省略。

托勒密十三世打算成为主要的统治者，波西努斯则作为幕后操控者。

托勒密十三世·西奥斯·菲洛帕托尔和波西努斯设法迫使克利奥帕特拉七世 (cleopatra VII) 逃往叙利亚，但她很快组织了自己的军队，并在埃及爆发了内战。

与此同时，她的另一位姐姐阿尔西诺四世 (Arsoe IV) 也开始宣称自己为埃及女王 (公元前48–47年在位)，进一步复杂化了局势。

此时，战败的罗马将军庞培 (popey) 来到埃及，寻求躲避追击他的竞争对手盖乌斯·尤利乌斯·恺撒 (Gai Juli caesar)。

最初，托勒密十三世假装接受了庞培的请求，但在公元前48年9月29日，他指使阿基拉斯 (Achils) 和卢修斯·塞普提米乌斯 (Luci Septii) 谋杀了庞培，希望在恺撒到达时能够博得他的青睐。

当恺撒到达埃及时，庞培的头颅被呈上。

据说，恺撒没有感到高兴，反而表现出厌恶，并命令寻找庞培的遗体，给予他一个正规的罗马葬礼。

克利奥帕特拉七世成功赢得了恺撒的青睐，并成为他的情妇。

恺撒安排处决了波西努斯，并将克利奥帕特拉七世重新立为埃及女王，尽管她从未正式放弃与托勒密十三世的婚姻。

尽管如此，托勒密十三世仍然决心废除克利奥帕特拉七世，他与阿尔西诺伊四世结盟，共同组织了忠于他们的军队，与忠于克利奥帕特拉七世的军队，以及那部分随恺撒到来的相对较小的军队作战。

公元前48年12月中旬，双方在亚历山大城内发生了战斗。